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天能VE-586转【zhuǎn】膜丨5步【bù】教你跑出漂亮的大分子western-blot图【tú】诀窍

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前言:

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如果你的蛋白分子量【liàng】大于150KD,但【dàn】苦于一【yī】直【zhí】跑不出好看【kàn】的western-blot,那么这篇文章,你【nǐ】一定得看。

选对凝胶很重要

3种最常见的凝【níng】胶【jiāo】包【bāo】括Tris-Glycine, Bis-Tris and Tris-Acetate. Tris-Glycine凝胶的PH为8.6,且保质期很短。在跑胶【jiāo】的过程中,PH还有上升的趋势,可【kě】达到9.5。这会导致【zhì】蛋白【bái】降解【jiě】和低分辨【biàn】率。

Bis-Tris凝胶的PH为6.4,相对Tris-Glycine凝胶,稳定性和保质期都有所增【zēng】加。但这种【zhǒng】凝胶【jiāo】需要在【zài】溶液中增加抗氧化剂,比如DTT,以维持蛋【dàn】白的还【hái】原性。

Tris-Acetate 凝胶【jiāo】的PH为7,跑大分子蛋白【bái】会呈现很【hěn】高的【de】分辨率。跑大分子蛋白时【shí】,我们推荐使【shǐ】用【yòng】Tris-Acetate 凝胶。

凝胶浓度很重要

既然选【xuǎn】择了Tris-Acetate 凝【níng】胶,还【hái】有几个要【yào】考虑的【de】问题。凝胶浓度【dù】与孔径【jìng】成反比【bǐ】:浓度【dù】越小,孔径越大。较大的蛋白质【zhì】更容易【yì】通过较大的【de】孔,所以我建议使用低百分比的凝胶,如7%。可以使【shǐ】用梯度凝胶或非梯度凝胶,梯【tī】度凝胶非【fēi】常【cháng】适合新样本。

提高转移buffer中的SDS,减少甲醇

转移buffer的组成至关重要【yào】。如果有【yǒu】甲醇存在,大分子【zǐ】蛋白很【hěn】容易沉【chén】淀。通过减少【shǎo】转移【yí】buffer中的甲醇百分比【bǐ】(10%或更低)来【lái】避免【miǎn】这种情【qíng】况发生【shēng】。为了进一步【bù】确保蛋白质【zhì】不会沉【chén】淀,考虑添加SDS至终浓度为0.1%。SDS向蛋白添加均【jun1】匀的负电荷,使得它们更容易从凝胶转移到膜上。

选择合适的膜

膜一般有PVDF膜或NC膜。跑大分【fèn】子【zǐ】蛋白选【xuǎn】择PVDF膜。如前面所说,如【rú】果有【yǒu】甲醇存在,大分子蛋【dàn】白很容【róng】易沉【chén】淀。而PVDF膜不需要在转移buffer中【zhōng】添加甲醇,目的蛋白转【zhuǎn】印的机会更【gèng】高。两种类型【xíng】的膜都【dōu】有各种孔径尺寸,最常见的是0.2um和0.45um。与凝【níng】胶一样,较大的【de】蛋【dàn】白比【bǐ】较【jiào】小【xiǎo】的更容易【yì】穿过大孔隙。大多数【shù】蛋白质(> 20kDa)可【kě】以用0.45um膜转【zhuǎn】移,避免使用0.2um孔径。

增加转印时间

在【zài】正确【què】地选择完凝胶、转印【yìn】膜【mó】及转移buffer后,转【zhuǎn】印正式开【kāi】始。半【bàn】干转快且方【fāng】便,但不适【shì】用于大分子【zǐ】蛋【dàn】白。我建议湿转,因为大【dà】分子蛋白转移时间很慢,推荐350-400 mA转移【yí】90min或 4°C,40 mA,转【zhuǎn】印过【guò】夜。


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